<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">intechngu</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Vestnik NSU. Series: Information Technologies</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1818-7900</issn><issn pub-type="epub">2410-0420</issn><publisher><publisher-name>НГУ</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.25205/1818-7900-2020-18-1-83-93</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">intechngu-124</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Виртуальный атлас персонифицированной анатомии человека «SkiaAtlas» и возможности его применения</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Virtual Atlas of Personified Human Anatomy “SkiaAtlas” and the Possibility of Its Application</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Щеглов</surname><given-names>Б. О.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shcheglov</surname><given-names>B. O.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">b.shcheglov@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Безуленко</surname><given-names>Н. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Bezulenko</surname><given-names>N. I.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">bezulenko.nik@bk.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Атащиков</surname><given-names>С. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Atashchikov</surname><given-names>S. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">kadkag@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Щеглова</surname><given-names>С. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Scheglova</surname><given-names>S. N.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">schegloff@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">Дальневосточный федеральный университет<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">Far Eastern Federal University<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru">Северо-Восточный государственный университет<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">Northeast State University<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2020</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>11</day><month>11</month><year>2020</year></pub-date><volume>18</volume><issue>1</issue><fpage>83</fpage><lpage>93</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Щеглов Б.О., Безуленко Н.И., Атащиков С.А., Щеглова С.Н., 2020</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Щеглов Б.О., Безуленко Н.И., Атащиков С.А., Щеглова С.Н.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Shcheglov B.O., Bezulenko N.I., Atashchikov S.A., Scheglova S.N.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://intechngu.elpub.ru/jour/article/view/124">https://intechngu.elpub.ru/jour/article/view/124</self-uri><abstract><p>Работа посвящена описанию структуры разработанного программного обеспечения «SkiaAtlas», которое ориентировано на работу с индивидуальными анатомическими моделями человеческого тела и физиологических показателей пациента. Показаны проблемы использования макетного и постсекционного материала в обучении студентов-медиков, а также преимущества разработанной информационной системы по сравнению с данными моделями. Виртуальные анатомические модели были получены из анонимизированных DICOM-изображений магнитно-резонансной томографии (МРТ) и компьютерной томографии (КТ). Описаны подсистемы информационной системы: PACS-сервер, где хранятся все данные (серверная часть), и веб-приложение, где пользователь ведет работу с данными (клиентская часть). Подробно описаны модули информационной системы, реализованные в виде различных программных продуктов: модуль импорта данных, модуль анонимизации, модуль СУБД, модуль визуализации и др. Порядок работы этих модулей проиллюстрирован схематично. Показано, на каких языках программирования и фреймворках реализовано данное программное обеспечение, представлены преимущества выбора данных средств реализации относительно других программных продуктов. Детально описан процесс удаления персональных данных из DICOM-файлов; процесс получения «маски» объекта на снимке, которая затем используется для получения объемных моделей внутренних органов пациента. Наглядно описан процесс пользовательской работы с базой данных и поиск патологий с помощью инструментов интерфейса системы. Показаны возможности применения данной информационной системы в образовательной сфере (иллюстрация конкретных клинических случаев с целью поиска причинно-следственных связей в патогенезе различных заболеваний) и для развития клинического мышления у студента. На конкретном клиническом случае приведен пример того, как программа «SkiaAtlas» использовалась для поиска патологии - объемного образования левого полушария головного мозга.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The work is devoted to the description of the structure of the developed SkiaAtlas software, which is focused on working with individual anatomical models of the human body and physiological parameters of the patient. The problem of using mock-up and post-sectional material in teaching medical students, and why the developed information system has advantages over these models, is shown. Virtual anatomical models were obtained from anonymous DICOM images of magnetic resonance imaging (MRI) and computed tomography (CT). The subsystems of the information system are described: a PACS server where all data is stored (server part) and a web application where the user works with data (client part). The information system modules implemented in the form of various software products are described in detail: data import module, anonymization module, DBMS module, visualization module, etc. The operation of these modules is illustrated schematically. It is shown in what programming languages and frameworks this software is implemented, and advantages of choosing these implementation tools relative to software are shown. The process of deleting personal data from DICOM files is described in detail; the process of obtaining the “mask” of the object in the picture, which is then used to obtain three-dimensional models of the patient’s internal organs. The process of user work with the database and the search for pathologies using the system interface tools are clearly described. The possibilities of using this information system in the educational field are shown - an illustration of specific clinical cases in order to search for cause-effect relationships in the pathogenesis of various diseases and the development of clinical thinking in a student. In a specific clinical case, an example is given of how the SkiaAtlas program was used to search for a pathology - a volumetric formation of the left hemisphere of the brain.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>анатомия человека</kwd><kwd>программное обеспечение</kwd><kwd>база данных</kwd><kwd>персонализированная медицина</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>PACS-структура сервера</kwd><kwd>human anatomy</kwd><kwd>software</kwd><kwd>PACS server structure</kwd><kwd>database</kwd><kwd>personalized medicine</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
